pyphi documentation

Contents:

• pyphi.calc module
  • ma57_dummy_check()
  • add_auto_obs_id()
  • f99()
  • f95()
  • spe_ci()
  • single_score_conf_int()
  • scores_conf_int_calc()
  • clean_htmls()
  • z2n()
  • n2z()
  • mean()
  • std()
  • meancenterscale()
  • find()
  • pca()
  • pca_()
  • pls_cca()
  • pls()
  • pls_()
  • hott2()
  • pca_pred()
  • pls_pred()
  • spe()
  • lwpls()
  • contributions()
  • clean_empty_rows()
  • clean_low_variances()
  • spectra_snv()
  • spectra_savgol()
  • spectra_mean_center()
  • spectra_autoscale()
  • spectra_baseline_correction()
  • spectra_msc()
  • bootstrap_pls()
  • bootstrap_pls_pred()
  • np2D2pyomo()
  • np1D2pyomo()
  • adapt_pls_4_pyomo()
  • prep_pca_4_MDbyNLP()
  • prep_pls_4_MDbyNLP()
  • conv_pls_2_eiot()
  • cat_2_matrix()
  • mbpls()
  • replicate_data()
  • export_2_gproms()
  • unique()
  • parse_materials()
  • isin_ordered_col0()
  • reconcile_rows()
  • reconcile_rows_to_columns()
  • lpls()
  • lpls_pred()
  • jrpls()
  • jrpls_pred()
  • tpls()
  • jypls()
  • jypls_pred()
  • tpls_pred()
  • varimax_()
  • varimax_rotation()
  • findstr()
  • evalvar()
  • writeeq()
  • build_polynomial()
  • cca()
  • cca_multi()
• pyphi.plots module
  • r2pv()
  • loadings()
  • loadings_map()
  • weighted_loadings()
  • vip()
  • score_scatter()
  • score_line()
  • diagnostics()
  • predvsobs()
  • contributions_plot()
  • mb_weights()
  • mb_r2pb()
  • mb_vip()
  • barplot()
  • lineplot()
  • plot_spectra()
  • scatter_with_labels()
• pyphi.batch module
  • unique()
  • mean()
  • simple_align()
  • phase_simple_align()
  • phase_iv_align()
  • plot_var_all_batches()
  • plot_batch()
  • unfold_horizontal()
  • refold_horizontal()
  • loadings()
  • loadings_abs_integral()
  • batch_vip()
  • r2pv()
  • mpca()
  • monitor()
  • mpls()
  • find()
  • clean_empty_rows()
  • phase_sampling_dist()
  • predict()
  • contributions()
  • build_rel_time()
  • descriptors()